据《漕桥乡志》记载,该寺建于唐咸通一年(860),距今1100余年。宋太平兴国时(976~983)修缮、扩建108间,后几经战乱兴废,至明万历年间(1573~1620),造大雄宝殿、天王殿、观音殿、罗汉堂、梵宫、慧贞阁、藏经楼以及禅堂、斋堂。大顶寺因地僻人稀,香火日少,至清朝末年,并入天宁寺作为下院,留下僧田36亩。大顶寺面向太湖,三面依山,地势险要而隐蔽。民国33年(1944)中秋前夕,驻漕日军进行清剿,光华、光生两僧被捕,坚贞不屈,英勇就义,表现了僧人的爱国精神。1949年初,仅存残垣败壁10余间。“文化大革命”中全部拆除,建造种子场。
1995年12月大顶寺批准开放。现有大雄宝殿、弥勒殿、大悲殿、财神殿、膳房、僧寮、办公室及其他生活用房20余间,建筑面积1080平方米,占地10亩。万佛青铜钟和重3吨、高3米的宝鼎耸立在大雄宝殿前。每逢初一、月半及其他法会期间,朝佛信众都远道而来,拈香拜佛。
负责人田光林居士。